Eu dei uma pesquisada e existem alguns projetos que usam a 12ax7 (como o que postarei abaixo), e os valores são iguais em todos os componentes, por isso a minha duvida em encontrar o problema.
Então, se você retirou a primeira 12AX7 e o ruído sumiu, isso é uma boa pista de que o problema pode se originar nela. Agora o fato deste mesmo pedaço de circuito ser igual em outros modelos, não quer dizer que ele vai funcionar neste modelo, porque a etapa seguinte influencia (no ganho, na resposta em frequência, etc) e interage com esta etapa inicial. Como o Eduardo disse, primeiro monte o projeto inicial como ele é, pra depois ver se tem defeito ou não. Com uma modificação radical logo de cara, você fica sem ponto de partida.
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Vocês descartariam a hipótese do problema também estar na fonte? Pelo fato de usar capacitores em serie, sem os resistores em paralelo e também sendo 22uF, sendo que o recomendado pelo projeto é 16uF?
Não deve ter problema. Os valores baixos de capacitância no filtro do projeto original são por causa da válvula retificadora não aceitar capacitores de filtro de valor mais alto. Mas com retificadores de estado sólido, essa limitação é menos crítica. Poderia até usar capacitores de 100uF, que os diodos aguentam. Os resistores de equalização servem para que não ocorra excesso de tensão num capacitor só e para fazer a descarga dos capacitores quando desligar o amplificador.