Existe mais uma variável nesse circuito, que é a amplitude da onda do oscilador. Se ela for muito grande, mesmo com a polarização baixa da base de Q1 o trêmulo ainda atua de forma entrecortada, pois somente os picos da onda farão o transístor funcionar, mesmo com o depth no mínimo. Essa é uma característica desse projeto.
Uma maneira de controlar isso seria colocar outro controle de "volume", entre C1 e R6. É claro que isso complica um pouco mais o projeto, mas é uma maneira de melhorá-lo.
Existem outros projetos que com certeza funcionam de maneira mais eficaz, mas aí você vai ter que iniciar novamente suas pesquisas.